Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM8AQ9HCN3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms