Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVMER34-1Q9H9K5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms