Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH2D4AQ9H788 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4AQ9H788 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms