Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms