Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf49Q9H6J7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms