Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD4Q9H223 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms