Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SMG9Q9H0W8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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