Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM49AQ9H0Q0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms