Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF541Q9H0D2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF541Q9H0D2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms