Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE41Q9C0J9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms