Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2OQ9C0C9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2OQ9C0C9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms