Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXP3Q9BZS1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXP3Q9BZS1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms