Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD3Q9BZ95 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms