Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms