Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms