Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
CECR2Q9BXF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CECR2Q9BXF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CECR2Q9BXF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms