Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL3Q9BXA9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms