Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC2P3Q9BVR0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms