Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KATNB1Q9BVA0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms