Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRACR2AQ9BSW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms