Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms