Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ECSITQ9BQ95 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECSITQ9BQ95 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms