Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms