Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3CQ99985 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3CQ99985 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms