Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP8Q99708 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms