Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP4Q99569 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms