Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC5LQ99459 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC5LQ99459 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms