Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT12Q99456 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms