Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RSF1Q96T23 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RSF1Q96T23 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RSF1Q96T23 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms