Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A12Q96S37 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A12Q96S37 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A12Q96S37 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms