Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGS1Q96RS0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms