Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3IPQ96QF0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms