Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms