Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85AQ96PX6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms