Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SORCS2Q96PQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms