Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP3Q96P20 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms