Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF558Q96NG5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms