Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms