Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD4Q96KN9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GJD4Q96KN9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms