Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms