Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VCPIP1Q96JH7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms