Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNFT2Q96EX2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms