Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CMTM5Q96DZ9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms