Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM44Q96DX7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms