Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms