Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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FAM3DQ96BQ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3DQ96BQ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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