Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms