Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms