Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms