Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCE1Q969G3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms